Die Stiftung wird durch das Amt für Jugend, Schule und Sport der Kreisstadt Siegburg unterstützt und beraten. Es besteht eine enge Zusammenarbeit mit der Stadt Siegburg. Der Bürgermeister der Stadt ist Mitglied des Stiftungsrates.
Unterstützt wird die Nikolausstiftung von der Siegwerk Druckfarben AG & Co. KGaA.
Größere Projekte werden in Kooperation umgesetzt.